S.T.A.L.K.E.R. 2: Heart of Chornobyl comienza con una cinemática que ofrece poca explicación de lo que está sucediendo. Un vehículo desconocido está llevando al héroe a la Zona, pero comienza una emisión. Después de la tormenta, Skif (el nombre del personaje principal) necesita activar un cierto Escáner. Este dispositivo le permitirá energizar un antiguo artefacto. Quiere intercambiarlo con un conocido — German, para ayudar a organizar una nueva vida.
Cuando obtengas el control y te familiarices con los controles básicos, avanza hacia la alta pared. Este es el Perímetro que rodea la Zona. Necesitas entrar. Siguiendo el marcador de objetivo, pasarás rápidamente por un agujero en la pared.
La tarea se actualizará. Necesitas descender al alcantarillado. Inmediatamente, nota la pared delante. Hay un armario con un botiquín. Más adelante, necesitas romper las tablas con un cuchillo; de lo contrario, no podrás continuar. En la mesa, puedes recoger comida enlatada. Eventualmente, llegarás a una puerta cerrada con un candado. Rompe la puerta con un cuchillo para continuar.
Avanza por el alcantarillado hasta que veas un rayo de bola. Esta es la primera anomalía. Mantente a la derecha para buscar el primer cadáver de soldado. Tendrá algunos suministros. También encontrarás una tableta, y un punto de interés aparecerá en el mapa. Para evitar la anomalía que patrulla, mantente a la derecha y camina a lo largo de las tuberías.
Eventualmente, deberías poder salir del alcantarillado sin problemas. Tan pronto como estés de vuelta en el suelo, el primer mutante — una carne — te atacará. Después de derrotarlo, sigue el marcador de objetivo. Es probable que sientas hambre para este momento. Este es un debuff negativo, así que presta atención a la casa en tu camino hacia el objetivo. Allí puedes encontrar salchicha, que resolverá temporalmente el problema.
Entra en la casa con la luz encendida. Sube las escaleras al segundo piso y observa el tiroteo a lo lejos. Dirígete allí y verás un gran edificio de búnker. Sube y abre la escotilla.
Dentro, hay muchos cadáveres para registrar. Ve recto y gira a la izquierda para recoger un detector de artefactos de un científico. Tu tarea es encontrar al Dr. Negoda. Sal del pasillo principal y gira inmediatamente a la izquierda. Encontrarás el cadáver de Negoda, después de lo cual German contactará a Skif, y la tarea se actualizará — necesitas encontrar la laptop de Negoda.
Está cerca, en la habitación que probablemente inspeccionaste tan pronto como entraste en el búnker. Después de una corta cinemática, Pripoy contactará a Skif. Habla con él. Dado que ya encontraste el detector de artefactos, ahora necesitas encontrar el artefacto en sí, que ayudará a proteger contra la radiación.
Sal del búnker donde encontraste el detector y sigue el marcador de objetivo. Entrarás en un pantano ácido, pero gracias al detector, encontrarás rápidamente el artefacto. Tan pronto como llegues al suelo, aparecerá un chupasangre. La lucha con él no es fácil, así que asegúrate de tener lista una de las rifles encontradas.
Dirígete hacia el objetivo y configura el Escáner. Después de que se cargue, ten cuidado con las descargas eléctricas. Las mini anomalías causan daños significativos. No funcionará cargar el dispositivo, así que muévete al siguiente punto.
Te encontrarás con un campamento de bandidos. Derrota a los enemigos y recoge el botín, incluyendo una escopeta recortada. Continúa adelante. Verás un barco abandonado: corre más allá, ya que hay una anomalía invisible que causa mucho daño. Configura el Escáner en el segundo punto, y después de que falle, recógelo y avanza. Recibirás una dosis significativa de radiación, pero para este momento deberías tener algo para mitigarlo. Continúa hacia el marcador.
Skif llegará a una pequeña estructura; si lo deseas, siéntete libre de inspeccionarla. Configura el Escáner por tercera vez, después de lo cual se reproducirá una larga cinemática. La introducción al juego está completa.