La historia principal habla del grupo más cerrado de la Zona: los "Mercenarios". Qué objetivos perseguían los mercenarios, con quién se asociaron en su última tarea y a qué condujeron sus acciones: el personaje principal lo aprende mientras se acerca a la central nuclear de Chernobyl. Tendrás que visitar la base de los Mercenarios, comunicarte con el líder del grupo, descubrir cómo Scar se convirtió en mercenario y qué hizo, pero para ello tendrás que recorrer un largo camino. Estilo narrativo en el género de investigación detectivesca.

La guerra de facciones no está desactivada (después de todo, este es el "truco" del ChN), está entretejida en la trama.