Shin Megami Tensei: Persona 3 — сочетая в себе элементы традиционной японской ролевой игры и симулятора, геймплей позволяет день за днём прожить жизнь протагониста Макото Юки (Минато Арисато в манге), посещающего школу и улучшающего свои отношения с другими героями. Каждый день разбит на несколько частей, таких как «Утро», «После школы» или «Вечер»; большинство действий доступны лишь в определённое время дня. Свободное время может быть потрачено на различные действия, такие как посещение спортивного клуба, просмотр фильма в кинотеатре, похода в кафе или общения с кем-либо для улучшения «социальной связи».