Ratchet & Clank: Into The Nexus: después de los eventos de Full Frontal Assault, Ratchet y Clank logran atrapar a uno de los criminales más peligrosos de la galaxia: Vendra Prog. La Fuerza de Defensa de la Galaxia Polaris ordena a los héroes, así como a sus amigos Zephyr y Kronk, que escolten a Vendra a la prisión en el planeta Vartax para cumplir su condena. Sin embargo, la nave prisión resulta dañada al caer en un campo de asteroides, y mientras Ratchet y Clank la reparan, son atacados por mercenarios de la firma Self-Bandit, liderados por el hermano gemelo de Vendra, Neftin.
Los mercenarios abordan el barco, neutralizan a Kronk y Zephyr y liberan a Vendra. Ratchet y Clank intentan impedir que ella escape, pero Vendra los detiene fácilmente a ambos con su "magia". Los gemelos abandonan el barco después de volarlo. Zephyr y Kronk mueren, y Ratchet y Clank son arrojados al espacio exterior, pero sobreviven colándose en una de las naves mercenarias y escondiéndose en una caja de suministros.