El personaje principal y sus amigos, Cheval y Lilia, buscan un huevo de monstruo. Encuentran un nido con uno de ellos, y de él nace Rathalos, quien casi de inmediato se apega al personaje principal. Llaman a la criatura Ratha. Sin embargo, al regresar a Hakum Village, es atacada por un Nargacuga furioso, poseído por una enfermedad llamada Peste Negra. Ratha intenta proteger la aldea, pero parece que lo matan. La madre de Cheval, Vlau, también muere durante el ataque, lo que lo lleva a la desesperación.