Command & Conquer: Generals es un juego de estrategia en tiempo real con vista isométrica. La trama tiene lugar en 2020. Las tropas del Ejército de Liberación Global (GLA) organizan un ataque terrorista en un desfile en Beijing y roban una ojiva nuclear para luego detonarla. Este fue el motivo de la invasión del territorio chino. China, después de haber movilizado tropas, se ve obligada a repeler a los invasores, al mismo tiempo que el GLA hace volar la presa de las Tres Gargantas y el centro de exposiciones de Hong Kong. China está desplazando a las tropas del GLA de su territorio, estas últimas se están instalando en los territorios de Pakistán, Kazajstán, Uzbekistán y Afganistán, y están desestabilizando la situación allí, apoderándose de objetos estratégicos clave. Al final, el GLA se apodera del cosmódromo de Baikonur y ataca a Estados Unidos y Europa con misiles que contienen el químico, envenenando todo a su alrededor. Debido a este ataque terrorista, Estados Unidos va a la guerra contra las fuerzas del GLA.
Estados Unidos está movilizando tropas en Medio Oriente y transfiriéndolas a Kazajstán. Durante los combates, el GLA intentó realizar un contraataque, pero Estados Unidos pudo hacer retroceder a este último hasta su último bastión en la región de Akmola. Con el apoyo de China, Estados Unidos destruye la última base del GLA.