Blazing Angels 2: Misiones secretas de la Segunda Guerra Mundial: el juego comienza cuando el jugador toma el control del Capitán Robinson (el personaje principal) durante un espectáculo aéreo posterior a la Segunda Guerra Mundial. Después de realizar varias acrobacias, Robinson comienza a hablar sobre los acontecimientos de su escuadrón. El juego nos retrotrae inmediatamente a un ataque alemán a un aeródromo de la RAF, del que el jugador debe defenderse. Aquí se presenta al primer compañero de escuadrón de Robinson, Teach.
Luego vuelan a Francia y dejan a la agente aliada Marguerite en el tren. Luego proceden a destruir numerosas unidades terrestres y aéreas antes de retirarse. Luego se unen a un portaaviones que está a punto de atacar a la flota italiana en Tarento. Durante el ataque, Robinson logra convencer a su viejo conocido Milo para que se una al equipo. El escuadrón está completo cuando vuelan a El Cairo y reciben un jinete de combate llamado Thorpe.