Sonic, Tails, Knuckles y Amy viajan a las Islas de la Estrella del Norte para derrotar al malvado Dr. Eggman. Los héroes usan nuevas habilidades, cuyo poder les otorga las misteriosas Chaos Emeralds. El juego tiene modo para un jugador y multijugador competitivo. Gracias al modo cooperativo, los jugadores pueden seguir la historia con amigos.