Scarlet Nexus es un colorido juego de aventuras y terror con vista en tercera persona al estilo japonés de los creadores de la serie Tales of. En un futuro lejano, la humanidad se enfrenta a los Otros: ramos agresivos con piernas de mujer. El destino de la humanidad está en manos de un grupo de élite de soldados psiónicos de la OSF que deben eliminar la amenaza. El personaje principal es Yuito Sumeragi, quien, según la trama, se une al escuadrón para luchar contra los Otros que amenazan a la humanidad. En el mundo del juego, el cerebro humano está conectado a una red social llamada Psynet. Esto permite a las personas utilizar los servicios sociales y recibir nueva información. Al estar conectado a Psynet, Yuito podrá tomar prestadas habilidades de otras personas y usarlas en la batalla contra enemigos.