Remaster de la primera Metroid Prime. La cazarrecompensas intergaláctica Samus Aran recibe una señal de socorro de una fragata destrozada en la órbita del planeta Tallon IV. La fragata es una nave de investigación de los piratas espaciales, donde se llevan a cabo experimentos genéticos. Ahora la protagonista debe explorar el planeta para poner fin a la amenaza.