Exogenesis: Perils of Rebirth es una novela de aventuras visuales con elementos de anime en un entorno post-apocalíptico. De las cenizas de la guerra, la humanidad lucha por sobrevivir en las garras de una misteriosa organización conocida como Sanctus Ordo Illuminatus. Algunas personas intentan rebelarse creando una fuerza revolucionaria llamada Ejército Popular de Dios. Es el año 2069: el heterogéneo grupo de cazadores de tesoros de Yudai Sayashi en Durchhalten sufre una tragedia. El mayor tesoro, el Sueño Dorado, está a su alcance. Pero la hermana de Yu Miho cae en una trampa mortal y todo se desmorona. Dos años más tarde, Yu hace un descubrimiento sorprendente. La mítica Arca de Noé, sobre la que existen leyendas.