Quantum Conscience es una novela visual futurista. Una guerra secreta se libra entre dos agencias intergalácticas en esta dramática novela visual. Uno de ellos, ARCHON, está desarrollando tecnología que puede penetrar en la mente de las personas. Ya han aterrorizado un planeta llamado Teballay y esperan utilizar su tecnología de lectura de mentes para difundir su poder por toda la galaxia. La segunda organización, FOE (Libertad de las Élites), quiere destruir la tecnología ARCHON en nombre de la libertad. Cuando una joven soldado FOE (tú eliges tu género) llamada Blair obtiene la capacidad de leer la mente gracias al experimento ARCHON, descubre que sus lealtades están divididas entre ambos bandos. Que Blair ayude o derrote al enemigo depende de cómo uses su poder.