Ace Combat 5: The Unsung War — по игровому процессу режимы одинаковы: перед каждой миссией игрок проходит инструктаж, в который входят текущее положение дел, предпосылки и цели операции, и выбирает один из доступных ему самолётов и вооружение. Для прохождения миссии игроку необходимо выполнить все её цели в течение определённого промежутка времени, причём в некоторых миссиях присутствует обновление целей. Задачами миссий могут служить как уничтожение всех вражеских самолётов, так и защита конкретной цели от вражеского огня. Прохождение некоторых миссий разблокирует такие мини-игры, как взлёт, посадка и дозаправка в воздухе.